本校自民國85年改制為國立臺灣體育學院，並成立競技運動學系，於99年經教育部通過自原有競技運動學系下另成立球類運動學系，以銜接並發展我國球類競技運動之水準，本校於100年8月1日正式改名為國立臺灣體育運動大學，本系朝培養球類優秀運動員與專業運動教練邁進。
我國球類運動在國際競賽場合之成就，已是國人及國家之所重視，諸如棒球、軟式網球、高爾夫球等國際成績優異之球類運動，為促進各項球類運動之整合，以提升教學與訓練品質，本系選定亞、奧運之競賽種類，以其中我國較具優勢及國內運動人口較多者，為重點發展之種類。
本系之師資、科學儀器、圖書設備等資源可充分支援各項系務之發展，更可因妥善整合，得以提升教學、訓練以及學術研究等方向之品質。