本校為一所綜合大學，體育學系學士班是本校於民國52年創校15個系所之一，隸屬理學院。本系並於65學年度分設「體育」、「舞蹈」二組，舞蹈組後於71學年度獨立成系並改隸屬藝術學院。72學年度本系又增設「國術組」，後於86學年度獨立成系。由於體育運動蓬勃發展，國內相關體育運動與休閒觀光科系已迅速蓬勃成長，為增強本系發展的優勢特色，於93學年度起招生分成「運動保健與休閒管理」及「運動競技」兩組，而因應社會之發展所需，運動保健與休閒管理組於100學年度核定成立「運動與健康促進學系」並開始招生。
為培育更多運動科研人才，83學年，又創立運動教練研究所碩士班，95年增設博士班，於97年6月提報本系與運動教練研究所於98學年度合併於體育學系之下，運動教練研究所則更名為「體育學系運動教練碩士班、博士班」，本案業經教育部台高（一）字第0970187952A號函（97年12月3日第1615次行政會議記錄94-99頁）；及教育部台高（一）字第0970262461A號函核定。
本系所設置目的在培育具國際觀、健全人格與專業能力之優秀體育與運動人才。