大學部
1.運用數學、科學及工程知識能力
2.設計與執行化工生技相關實驗，以及分析與解釋數據知能力
3.執行化工生技實務所需技術、技巧及使用現代工具的能力
4.設計化工生技之系統、元件或製程之能力
5.具備計畫管理、有效溝通與團隊合作之能力
6.發掘、分析、應用研究成果及因應複雜且整合性工程問題之能力
7.認識時事議題、瞭解化工生技之技術對環境、社會及全球的影響，並培養持續學習的習慣與能力
8.理解及應用專業倫理，認知社會責任及尊重多元觀點

研究所
1.運用化工生技領域之專業知識與能力
2.運用化工生技領域之專業知識以進行策畫及執行專題研究之能力
3.研讀專業資料、表達研究成果及撰寫專業論文之能力
4.運用基礎理論以創新思考及獨立解決問題之能力
5.與不同領域人員溝通、協調與整合之能力
6.具備良好的國際視野
7.具備領導、規劃及管理研究計畫的能力
8.厚植基礎能力以培養終身自我學習成長的能力

為提升高等教育品質，培育跨領域人才，提高就業競爭力，推動跨領域學程，接軌國際發展趨勢，透過化學工程學系及生物工程學系的系所整併，進行師資、課程、設備、空間等資源的整合，使新學程得以專業優勢互補而更趨於完整，以創造新學程優質、精緻、跨領域之特色。

1.培育學生具備化學工程與生物科技基礎知識以建立永續學習的能力。
2.強調學生由實作中學習、培養發現問題及解決問題之能力，並啟發創新思維，進而培育創新事業的人才。
3.加強學生團隊合作和跨領域學習能力。
4.教育學生具備工程倫理及國際視野並勇於承擔社會責任。