民國59年：本系始創–「台南家政專科學校音樂科」為南臺灣第一所五年制音樂科，設立鍵盤組、聲樂組、管樂組和弦樂組。
民國61年：增設舞蹈組。
民國75年：增設作曲組；舞蹈組另設立舞蹈科。
民國86年：本校改制為「台南女子技術學院」，本系除五年制音樂科外，並增設二年制音樂系。
民國87年：增設傳統樂器組。
民國88年：設立二年制進修部音樂系在職專班。
民國90年：設立七年一貫制音樂系學士班。
民國91年：設立音樂系碩士班。
民國95年：本校改制為「台南科技大學」。
民國96年：設立音樂系碩士在職專班。
民國99年：本校更名為「台南應用科技大學」。