1846年 成立監理會
1989年 蘇州創辦博習書院（Buffington Institute）、宮巷書院（Kung Ha ng School），在上海創辦中西書院（Anglo-Chinese College)。
1990年 決議合併三書院，以宮巷書院為基礎，在蘇州天賜莊博習書院舊址，擴建為大學。1900年12月制定校董會章程，推林樂知（Young J. Allen）先生（萬國公報創辦人）為董事長、孫樂文先生（David L. Anderson）為校長。二十世紀初中國第一所民辦大學東吳大學正式誕生。
1901年 東吳大學創辦初期歷經三位美籍校長孫樂文（David L. Anderson）、葛賚恩（John W. Cline）及文乃史（W. Cline)及文乃史(W. B. Nance)。這個時期的辦學經費主要來自於捐款及學費。校源的教學大樓林堂、蓀堂及葛堂及教職學生宿舍等設施覆序興建完成，小圓規模日趨完整。學科發展包括文、理、醫學、神學及法科(在上海崑山路)，另有四所附中、二時鎖附小、惠寒國小、吳語學校等組成完整的東吳教育體系。各學科除在學數研究上表現突出，更為社會培養無數專業人才。學校以「Unto a Full-grown Man」為校訓強調學生人格的陶冶。五四運動期間，東吳學生籌組學生會，一般的學生社團則以學術研究、辯論及體育活動為主。東吳大學早期在三位校長的努力下，為日後校務發展奠定良好的基礎。
1926年 首先廢除宗教必修課程，禮拜儀式亦改為學生自由參加。繼而改組校董會，三分之二的成員改由中國人擔任。
1927年 楊永清先生當選首任中國籍校長，訂「養天地正氣，法古今完人」為中文校訓
1929年 南京國民政府正式核准東吳大學在國民政府註冊立案。此後十年各項校務發展成果豐碩令人矚目。
1930年 學校共有文、理及法三學院，十二個學系。在教學方面積極籌款推 動學術研究、加強師資陣容提昇教學品質、推動師生以其專業服務 社會。校園內主要建築設施均在此階段建成或動工。
1937年 爆發抗日戰爭，此後八年東吳大學蘇州上海兩校區受戰事影響，輾 轉遷徙各地。其間隨戰況發展演變，兩校區或各自遷校或與他校聯 合辦學，雖烽火連天但教學活動未曾稍息。
1945年 抗戰勝利，東吳大學師生紛紛自各地返回上海及蘇州校園，展開復校的艱鉅工作。
1949年 大陸易幟，國民政府遷台。東吳大學在台校友倡議復校。
1951年 中共進行院系調整，東吳大學在上海的法學院，併入華東政法學院 ，會計系併入上海財經學院；在蘇州的文理學院部份學系就地移交 蘇南師範學院。12月蘇南師範學院改名江蘇師範學院。
1952年 籌組董事會，於台北市漢口街借屋設東吳補習學校，設法政、商業會計及英文三科，另設比較法律一科，限大學肆業二年者報考。
1954年 教育部以東吳補習學校辦學績效卓著，核准先行成立東吳大學恢復 法學院，設法律、政治、經濟、會計四系並附設外國語文學系，為台灣第一所私立大學。
1957年 購得士林外雙溪土地七甲加上士林鎮公所贈與之土地共十五甲，此時石超庸校友接任院長，積極推動建校事宜。兩年內完成第一棟教學大樓（寵惠堂）及學生活動中心。
1961年 全校由台北市漢口街遷到外雙溪現址。至此東吳師生終於有了一個屬於自己的美麗校園。在台復校的過程艱辛 坎坷，衛理公會及美國基督教高等教育聯合會未予支持，物質條件極其窘困。但在董事會苦心奔走，海內外校友及教會熱誠捐助下，東吳依然堅守嚴謹校風踏實辦學，為東吳學子樹立了良好的典範。
1962年 遷入外雙溪校區後的二十年，是東吳大學在台復校後的關鍵成長期。歷經石超庸（任期1957~1968）、桂崇基（任期1968~1969）及端木愷（任期1969~1983）三任校長。石校長任內全心致力教學水準的提昇，學生成績採嚴格的淘汰率，為學校奠立穩定的根基。
1969年 教育部終於核准東吳大學恢復大學建制。端木校長接任後則積極開創發展，任內增設十二個學系、七個研究所、三個博士班，圖書館、哲生樓、音樂館及教師研究大樓等校舍相繼建成，又在台北市貴陽街設城區部，並興建兩棟教學大樓。教學設施日趨完善，校區規模已然成型。愛校的熱情凝聚了董事會、全體師生及校友，東吳人憑藉著堅強的毅力走過慘澹歲月，培育英才無數，締造了辦學佳績，也贏得社會的認同與支持。
1970年 此時期東吳大學發展為兩個校區，外雙溪校區位於文化風景區，安置文、外語及理三學院；城中校區位於政經文化中心，安置法、商兩學院及推廣部。兩校區統合運作，各有特色。
1983年 楊其銑（1983～1992）、章孝慈（1992～1995）及劉源俊（1996～2004）三任校長陸續增購校地、興建校舍、解決與台北市政府的校地爭議，並致力於提昇學術研究能力、拓展與國際及大陸的學術交流、推行校務運作制度化、與社區建立良好互動關係，此時國內各地校友會、系友會及校友總會亦相繼成立。
2000年 東吳與同源的蘇州大學同慶建校一百年
2004年 劉兆玄博士接任校長，將東吳定位為「一流的教學大學」，而本校亦自2005年起，連續四年均獲教育部「教學卓越計畫」億元以上獎補助，教學成果備受各界肯定。
2008年 外雙溪校區第一、第二教研大樓落成啟用。10月，黃鎮台博士接任校長，提出「舒適安全的校園空間」、「自尊尊人的處事態度」，及「互惠的整合型計畫」等軟硬體提升方案，期以卓越教學為基礎，配合特色化研究，培育兼具專業與領導知能之社會中堅人才。
2012年 3月潘維大博士接任校長，面對新世紀的下一個10年，本校將秉持優良的傳統，強調全人教育的精神與理念，以提升東吳大學國際觀與競爭力為目標，透過交流與合作建立國際知名度，在發展成為一流大學的道路上，站穩腳步、再創高峰。

東吳大學於1900年由基督教監理會在中國蘇州創辦，是中國第一所西制大學。1951年在台灣復校，也是台灣第一所私立大學。秉持中、西文校訓「養天地正氣、法古今完人」、「Unto a Full-Grown Man」的精神，致力發展成一所精緻、有特色、具前瞻性的優質教學大學，培育兼備專業與通識，富創意及執行力之社會中堅人才。展望未來，在本校優質教學的深厚基礎上，以整合、創新的概念，發揮綜效建立特色，以期在我國高等教育界建立卓然的領先地位。

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