本系大學部之教育目標在「培育具有宏觀視野、人文素養、學業知能的本土化及國際化企業管理人才。」課程強調管理理論與企業實務並重，並以華人企業管理為主軸，同時重視創意及創業能力的養成。學生畢業後可以在公民營企業、科技產業及各種朊務業任職，擔任各部門管理者、中低階主管及企業創業主，亦能具備繼續深造的能力。

企業管理學系碩士班：
碩士班一般生創設目標在「提供管理相關領域畢業生，接受進階管理教育的機會，強化其管理理論及企業實務運作管理能力。」特別是針尊國際化及跨國企業管理、台商或華人企業管理、創新及創業管理、品牌行銷及人力資源管理等研究領域，提供加深及加廣訓練，以培養畢業生成為公民營企業未來的中高階主管及創業家。

企業管理學系碩士在職專班：
為鼓勵企業管理者終身學習，滿足企業人士在職教育的需求，本系設立碩士在職專班目標在「提供企業中高階主管進修現代化、且最新的管理知識及技術，以增進學習者國際化視野，瞭解兩岸企業管理實務，提升其企業規劃、領導、決策、分析能力。」使學生能結合其實務經驗，引入管理議題，深化管理理論基礎，建立產學合作平台，以提升其個人及所屬企業的競爭力。期許畢業生能成為企業的領導者、國家社會的菁英。