為了強化醫務及健康事業體系之管理績效並培育健康產業相關業界所需的服務及管理人才，配合本校辦學理念、產業發展趨勢、本系之優劣勢與發展機會，以及評估本系學生背景，設定本系發展目標為「務實、專業、創新」

其具體發展目標與特色如下：

一、強調實務教學，建構學以致用的特色，培育符合產業變動需求之醫務管理與健康管理專業人才。
二、強化醫療、健康、管理與資訊之整合性專業，建立學生廣度與深度兼具之醫務行政管理能力。
三、結合資訊統計分析理論及ICD-10-CM疾病分類制度，訓練學生因應健保支付制度變化之能力。
四、發展各場域之健康促進理論與實務經驗，並建構本土及跨國的健康管理雲端服務。
五、結合資訊科技與設備，發展智慧醫療與智慧健康照護之創新教學模式。
六、以產業實務為導向，積極進行在地化服務，深化產學合作契機。

日四技之教育目標為：「培養具備醫務行政、病歷暨醫療資訊管理及健康管理理論與實務的專業，並擁有醫學、語言、人文、社會及統計計量素養的醫務管專業人才。」

其中「醫療產業管理組」更強化學生具備醫療產業分析及健保制度之因應能力，並擁有醫院專案規劃及病歷資訊管理之知識與技能；「健康管理組」則希望培育學生具備衛生行政及預防保健之觀念，並具備各場域之健康促進與健康管理專業知識和技能。

碩士班則「著重於學生之醫學、語言、醫務行政、資訊素養且能獨立解決問題，並依據健康產業需求及未來發展趨勢，培育具備醫療機構管理理論與實務之中高階管理人才，以及具備健康照護管理理論與實務之中高階管理人才。」；碩士在職專班「以招收產業界在職人員為主，讓在職人員透過此進修管道增加相關專業知識及研究能力，以成為醫療機構管理、健康照護管理及健康產業管理理論與實務兼備之中高階管理人才。」

一、四技生:以培養學生從事醫務行政管理及健康管理之必備基本專業知識與技能為主，並透過參與及實作過程深化所學知識。
二、碩士生:透過進階課程及研究探索培養學生決策分析、解決問題與實務管理之能力，成為醫療健康產業機構之中高階管理人才。