生物科技產業是本世紀的明星產業，近幾年來，與其他科技大國相仿，我國對生物科技的進步與人才培育也極為重視，以期協助台灣生物科技產業發展。因此，從先前的「國家八大科技發展重點」與「國家兩兆雙星計畫」開始，政府逐年投入大筆經費支援生技產業，並鼓勵大學院校培育生物科技人才。

有鑑於此，本校早於民國九十二年設立「生物技術系」，招收第一屆碩士班，成為本校第一個生物科技相關的系所。94年學年度正式招收第一屆大學日間部與進修部學生各一班。97學年度起，大學日間部學生增設為二班；100學年度改名為「生物科技系」。之後，進修部學生由於學制與學時的限制，修業過程中缺乏專題與實習的實作經驗，所訓練的畢業生逐漸與產業界的期待不符，因此隔年 （101學年度） 本系決定停招大學進修部學生。鑒於台灣各大藥廠、生技廠等缺乏製劑製造人才的問題，103學年度奉教育部核准更名為「生物科技暨製藥技術系」。

獨有特色

一、以學生本位導向引導學生於在學過程中了解自己在「生物科技」與「製藥技術」中的定位與角色。
二、以企業導向建置製劑製造設備與分析儀器。
三、以就業導向提昇學生的生物科技與醫藥產業中製劑製造與檢測分析之實務操作能力。
四、以產業導向設計課程強化學生對生物科技與生技醫藥市場現況之認識。
五、以業界實務教師和系專任師資共同協同教學提升教師在生物製劑製造與品質管制之實務教學知能。

未來願景

本系的發展重點乃結合政府機關、職訓單位、學校與策略聯盟廠商的優勢與各項資源，並以「無縫接軌」就業為導向，培養學生具備「生物科技」與「生技製藥」的基本學能與技術，並輔以「製劑製造」與「品質管制」之實務操作能力，使學生達到「畢業即就業、上班即上手」的目標。