本系自民國九十一年成立環境與安全工程系，開始招收四技日間部及進修部。九十三年度為配合國內企業90%以上均將環境保護與安全衛生併入同單位(安環處或安環室)實施，業界極需能同時具有環保與安衛本職學能之人才，也因應社會對環境與安全衛生問題日益重視之潮流及職場需求之趨勢，納入衛生教學與研究領域。課程規劃為環保與安衛課程並重，兩者課程發展均衡，環工與安衛課程必修學分比例為21：19，正式報教育部核准改名為環境與安全衛生工程系，為雲嘉南與高屏地區唯一同時培育具環境與安衛學識之中、高等人才之私立科技大學。必修課程為配合技職體系實務特性與證照考試之規劃，學生修畢本系課程可同時報考環保與安衛兩大領域證照，同時配合教育部南部地區教育資源規劃及整合校內資源而規劃以環境污染防制技術、職業安全與衛生等三大方向為發展主軸，整合該領域之研究，期能培育學生具備基礎環工領域技能，如水、空氣、廢棄物、毒性化學物質處理及管理能力；職業安全及衛生工程與管理專業知識，如工廠程序安全、安全衛生法規、風險危害評估、作業環境監測等，並透過實場實務之操作訓練、專業證照的取得以培育環安界之中高階人才。

中華醫事科技大學為配合國家環保及職安政策，促進產業競爭力提升，協助落實各項污染防治及勞工安全衛生政策及觀念，同時鑑於企業界已將環保與安衛融入同一事業體內，特於民國九十一年設立環境與安全工程系，創始之初僅收日間部學生1班與進修部學生1班，九十二年改收日間部學生2班，九十三年度配合業界實務需求，納入衛生教學與研究領域，正式報教育部核准改名為環境與安全衛生工程系（以下簡稱環安系）。除國立雲林科技大學與國立高雄第一科技大學兩校之環安系以外，本系為雲嘉南與高屏地區整合環境工程與安全衛生教育訓練之唯一私立科技大學。

在行政院「挑戰2008國家發展重點計畫」中，擬推動四項重點產業，其中一項為綠色產業含資源分選及再生利用、绿色資源再生利用，及資源化工業輔導等，在環保署部份則規劃進行發展廢棄物資源化之技術、建立各種污染物及前趨物之分析、監測及調查方法及落實災後環境污染防治措施等，故環境工程於國家未來發展計畫中實扮演非常重要的角色，另外綠色矽島亦為國家施政的主要方針亦為未來科技發展的趨勢。臺灣南部地區內有臺南科學園區、臺南科技工業區、高雄科學園區等科技與工業區及高雄、安平港區，產業發達，各種公、民營事業舉凡石化、煉油、鋼鐵、合板、塑膠、水泥、電鍍、發電廠、肥料、蓄牧、養殖等產業，大多名列全國之首位。在此眾多之產業，雖造就更多的就業機會，但也造成嚴重之環境污染與職業安全衛生問題。

本系畢業生在達成本系所訂定之專業核心能力後，完成環境與安全衛生工程之訓練，則能提供相關環安人才為社會及產業所用。加上民國102年7月31日經總統修正公布，更名「勞工安全衛生法」為「職業安全衛生法」後，「職業安全衛生法」明定適用於各業，將現有保障人數由670萬人擴大至1067萬人，職業安全衛生人員之需求亦隨之日益增加，而由全國職業安全衛生系所一年培育出大約1100位的畢業生，已無法因應市場的人力需求，因此本系的環工與職安衛的訓練更須跟上時代腳步、配合國家政策及產業需求。另一方面，民國99年6月5日訂定「環境教育法」，明定全國高中以下教師與學生必須受滿一年四小時的環境教育訓練，此一變革，更將本系學生出路由技術至教育服務的多元化大大提升。

因此，本系的成立目的悉依據上述國家發展需求與現今產業發展及社會需求，並配合本校教育理念及時代潮流，結合校內資源而規劃以環境污染防制技術、工業安全與衛生兩大方向為發展主軸，整合該領域之教學研究，期能培育學生具備水處理、空氣污染物控制、廢棄物清除與處理、毒性化學物質管理、職場環境與安全監測管理、工業與程序安全衛生等專業知識、實場實務之操作訓練、專業證照的取得以及經濟分析與工程實務管理等技能，並據此規劃本系多元化且具特色之相關課程，逐年更新本系所公用實驗室之各項軟硬體設備，使成為兼具人文及環安衛科技之優質學系。

因應社會對環境與安全衛生問題日益重視之潮流及職場需求之趨勢，結合傳統環境工程與安全衛生兩種領域之重點課程，本系自民國九十一年成立環境與安全工程系，開始招收四技日間部及進修部。九十三年度配合業界實務需求，納入衛生教學與研究領域，正式報教育部核准改名為環境與安全衛生工程系，為雲嘉南與高屏地區唯一同時培育具環境與安衛學識之中、高等人才之私立科技大學