本系成立於90學年度，招收進修部二年制一個班級。在91學年度時，成立了日間部四年制一個班。成立之初乃由電機系孵育並代管，在92學年度時本系開始著手進行與電機系分割之程序，93學年度起正式獨立資訊網路工程系。94學年度起日間部增為四技二班，98學年度於進修部新增假日班(在職專班)，招收四技學生一班，107學年度再增設研究所及提升整體研究所能量。同年開始進行新南向計畫，培育東南亞學子。