民國77年 | 日間部五專部成立

民國85年 | 本校校名更名為”嘉南藥理學院”，增設日夜二技部

民國87年 | 五專部停招

民國88年 | 二專部停招、增設日夜四技部

民國89年 | 本校校名更名為”嘉南藥理科技大學

民國93年 | 設立醫療資訊管理研究所

民國95年 | 增設進修學院二技部、研究所在職專班

民國97年 | 日間部二技停招、進修部四技停招

民國98年 | 進修部二技停招 ，系所合一更名為醫務管理系(碩士班含在職專班)

民國99年 | 進修部二技 與四技恢復招生

民國107年|進修部二技停招

民國108年|進修部四技停招

2023-民國112年

進修部二技恢復招生 本系教育目標為提供完備之醫療產業管理專業訓練，培育學生具備專業管理知識、解決問題能力及 熟悉資訊應用技能，並培養同學兼具管理領導之人文素養與人際溝通能力，以瞭解社會環境變遷、順應 醫療服務產業需求，並協助醫療暨健康相關產業提供高品質、高效率之健康照護與預防保健服務，促進 國人健康。