本系未來發展方向，除配合今後國家農業政策之調整與產業升級之走向外，並力求與產業需求之脈動結合。

特別是我國即將加入WTO之未來，為了抵抗外國農產品強勢競爭之衝擊，今後在農園藝作物生產上，如何降低生產成本以及提高產品品質，以增加我農產品之競爭力上，本系未來畢業學生，將扮演積極而 重要之角色。

本校位於炎熱南臺灣，南部熱帶、亞熱帶作物之生產，特別是園藝作物，將是未來加入WTO後最具競爭潛力之作物。亦因此，本系未來之地位與發展，不論從地理位置或肩負培育高級農園藝生產專業技術人員上，均將愈形重要。

本系今後除積極提升學生專業知識之水準外，並特別增強在農業自動化、機械化、科技化領域之知識與技術訓練，使學生畢業後，能勝任產業之需求。