雖然本學系學士班以培育兼具聽力語言專業能力和服務大眾精神的臨床人才為首要目標，於創系之初即考量到除了臨床服務之外，尚有不同面向的聽語專業有待推行和發展，包含教學培育工作、研究發展、社會倡議等等，因此訂定以下五大教育目標以及四大核心能力:

1.能(於醫療院所及相關機構)從事有關聽力及語言障礙之臨床服務工作。
2.能從事有關聽力、語言障礙及聽覺口語之教育工作。
3.具有從事聽力、語言相關研究之基本能力。
4.具有終身自我主動學習、獨立解決問題的能力。
5.具有從事於社區聽力語言保健醫療照護的倡導能力。
 
一.專業醫學基礎能力及專業聽語能力。
二.人文關懷能力。
三.管理及領導能力。
四.教學能力及研究能力。

溝通障礙所涵蓋的專業領域、臨床技巧和對生活內涵的影響既深且廣。要能達成學系所設定的教育目標與核心能力之養成，除了合宜的規畫之外，也需要對應的基礎資源加以支持。本校之教學醫院-馬偕紀念醫院不僅具有優異的小兒科醫護陣容，耳鼻喉科則是臺灣新生兒聽力篩檢的先驅，且在臺北及淡水院區皆具備優良聽語專業人員和完善設備之臨床聽語中心。學系專任教師之延聘，也根據不同專業領域需求進行規劃。因此，本校聽語學系在聽語障礙師資、設備與臨床案例處理經驗方面，皆具有深厚完整的基礎，可提供各類型評估與介入之教學與訓練。本學系的特色如下:
針對臨床專業工作所具備之能力設計規劃學系課程，持續調查臨床專業所需能力現況修正學系目標及核心能力。
課程內容與臨床緊密連結，並涵蓋廣泛專業。
課程設計著重實作教學，培養學生臨床技能。
課程規劃搭配聽語教學實習中心、臨床教育中心及研究實驗中心，設有各專業空間，備有國際化標準之聽力語言設備，且有與馬偕紀念醫院同步線上臨床教學的視訊設備。
與馬偕紀念醫院簽署建教合作，雙方共享儀器設備、教學與研究資源，並提供臨床見實習的機會。
課程規劃除透過內部機制持續改善，亦邀請國外學者加入審查。
導生時間課程規劃。
與國際學者/機構進行學術交流。
為培育高階聽語專業人才、善盡社會責任、深化聽語科學之基礎發展、提升臨床督導教學及管理專業，並促進新型態整合服務模式之開展，本學系設立系所合一且臨床實務與研究並重之聽力暨語言治療研究所。無論於課程、師資陣容和空間設備上，皆具有深厚紮實的聽語專業基礎。

除了聽語專業教學之外，對於學生研究和服務之發展，本學系特色如下:
經由多種課程設計並鼓勵學生申請大專生研究計畫提升學生臨床實務研究能力。
教師相關研究計畫聘任本學系學生為研究助理。
大一、大二學生可透過參與社團所舉辦的社會服務，例如:臺東達魯瑪克營隊、提供偏鄉地區、弱勢群體連續性服務;臺美營，從中拓展國際視野。此外，也可經由參與舉辦聽語相關營隊，不僅有助於推廣聽語教育，也能從中獲得成長和學習。大三、大四時則由學系安排進階專業課程，與馬偕醫學院鄰近教育單位和社區合作進行實務聽力語言篩檢及衛教服務。不但能夠提升學生聽語專業能力，也能由此回饋鄰近鄉里。

有鑑於臺灣對於高階聽語專業人才的需求，馬偕醫學院聽力暨語言治療學系於2019年成立碩士班，並招收第一屆碩士學生。由於聽語科學牽涉之專業領域至為廣泛，本學系教師群的研究方向涵蓋新生兒聽力篩檢、老人聽力學、聽覺輔具、老人嗓音、閱讀萌發、讀寫發展和神經語言學等議題。除了上述研究主題之外，本學系也與其他相關領域之專家，例如:生物醫學、醫學工程，進行合作，期許未來能成為各領域對於聽語科學和聽語障礙問題相關研究資訊的交換整合中心，促成人才培育、落實產學合作及提升醫療服務品質，以推動社會整體發展的正向循環。