本系前身—淡水工商管理專科學校「銀行管理科」，於民國55年設立，以國內高中、高職畢業生為招生對象，招收三年制專科學生。教學目標主要在培育銀行經營與管理之專業人才。民國57年銀行管理科亦奉准招收五年制專科學生，後因學校整體發展上之調整，民國62年停招五年制學生。民國83 年本校改制為淡水工商管理學院，原專科部停招，改收大學四年學制學生及提供三專畢業生進修之「三專畢業生在職進修專班」，民國89年再獲准招收「二年制在職進修專班」，招收對象為二、五專畢業生，皆授予學士學位。由於積極改善師資與設備，提昇教學品質，民國88年本校再奉准改名為真理大學。

本校改制學院時，本系正名為「財務金融學系」，設系目標訂為培育具有規劃、分析及實務操作能力之財務金融人才。在歷屆主任及全系老師的努力下，經教育部多次評鑑，成績均列優等，而92學年財經學院評鑑更榮獲第一名的佳績。畢業學生人數超過6，000人，根據校友就業統計資料顯示，以從事金融證券服務業居多數，在一般企業擔任各種管理職務或自行創業者次之。學生除能學以致用外，其所具備之專業能力，以及認真、負責與敬業樂群的服務態度，均深獲高度的評價與肯定，對國家社會之經濟發展，可謂助益良多。