全球變遷已嚴重干擾海洋系統的正常運作，有鑑於海洋生物資源的生產與利用，是近未來科技發展的重要趨勢，本校與中央研究院以水產生物科技產業之發展為主要目標，設立本博士學位學程，為海洋科技產業培育多元且具國際競爭力之高階研發人才。發展重點包括：

(1) 魚類分子生理領域；

(2) 生態與演化生物學領域；

(3) 極端環境與特殊生物領域；

(4) 水生動物疾病防治與疫苗開發；

(5)海洋新資源素材開發與檢測領域等，極具特色之生命科學研究。本學程透過專業、前瞻與創新的教學課程，訓練學生將相關知識有效轉化成創業軟實力，以達到真正綠色海洋永續產業發展的目標。