學士班:哲學與宗教、歷史與文化、社會學與人類學、解決複雜問題、積極傾聽、合作、創意力、閱讀理解

進修學士班:哲學與宗教、歷史與文化、社會學與人類學、解決複雜問題、積極傾聽、合作、創意力、閱讀理解、管理

碩士班:哲學與宗教、歷史與文化、社會學與人類學、解決複雜問題、積極傾聽、合作、創意力、批判思考、心理學

碩士在職專班:哲學與宗教、歷史與文化、社會學與人類學、解決複雜問題、積極傾聽、合作、創意力、批判思考、治療與諮商

博士班:哲學與宗教、社會學與人類學、解決複雜問題、積極傾聽、合作、創意力、批判思考、心理學

本系為臺灣唯一具有五個學制的宗教系所：學士班、進修學士班、碩士班、碩士在職專班、博士班。各學制有其不同之課程規劃與發展目標，希望能在多元課程的規劃、不同學制的課程提供與專業能力養成，為臺灣的宗教研究人才之培育，提供一個完整而豐富的學術場域。本系碩士班並與義大利歷史悠久而著名的佩魯賈大學簽訂「雙聯學制」，使得同學可以在畢業時同時取得臺灣與義大利雙碩士學位，並豐富自身的生命視野。

本系除宗教學本身學科之概論與進階、比較宗教與宗教交談課程外，也規劃各宗教傳統相關課程，希望同學能在宗教學本身學科視域研究的啟發下，同時具備不同宗教傳統之相關背景知識，期能成為具有學術研究能力之宗教研究人才。除課程之規劃與講授相當豐富而具特色外，本系更開設禮儀師證照課程、宗教文創課程、宗教與當代文化課程（電影、動畫、文學）等課程與課外講座，提供就學學生與當代流行文化對話之能力。

本系課程除以課堂講授為主要培育場域外，也提供許多不同的課外講座與學生自主活動，培育學生在課堂之外的相關實踐能力。例如：宗教地景訪查計畫、宗教雅敘、系圖演講、宗教小說出版等。在課程中，除以講授為主，並同時有影片觀賞與討論、校外參訪、自主研究計畫等內容，協助同學能根據自身的狀況與希望，培養更具實踐力的宗教人才。