本系配合國家教育政策及社會需要，於1969年7月成立會計統計學系，分「會計」、「統計」兩組。爾後因應市場對分析人才的需求，為強化統計專業訓練，於1973年獨立為統計學系。本系初成立時為單班制，招收社會組學生，1990年增為雙班，每年招收120名學生。為符合本系的發展方向，於2001年8月起調整系名為統計資訊學系（DepartmentofStatisticsandInformationScience），畢業授予管理學學士（BachelorofBusinessAdministration，簡稱B.B.A.）。本系隸屬之管理學院，本院於2005年4月15日通過AACSB國際商管學院促進協會認證，成為臺灣第一所通過AACSB認證之大學。

為培育兼具理論及實務整合應用之進階專業人才，本系於1995年8月創辦「應用統計研究所」，為國內第一所以應用統計專業人才培育為宗旨之獨立研究所。爾後，因各界對統計分析之需求日增，於2000年成立「應用統計研究所碩士在職專班」，提供在職人士良好的進修環境及學習規劃，增強其在工作上統計分析的專業能力。

為使教學及人才培育規劃更具整體性，於2010年8月1日起，統計資訊學系與應用統計研究所正式系所合一。屆此開始，「統計資訊學系」除學士班外，另設「應用統計碩士班」及「應用統計碩士在職專班」（Master'sPrograminAppliedStatistics），碩士班畢業後授與商學碩士（MasterofScienceinAppliedStatistics，M.S.）。