中國文化大學基於全球農業發展趨勢以及政府發展園藝產業之政策，乃於民國55年設立園藝學系，56年起招收第一屆學生。系設立宗旨為：「培育果樹、蔬菜與花卉等園藝作物之研究改良、生產利用及示範推廣之教學研究及創業人才。」

由於近代園藝科學教研領域，多已融入生物技術相關內容，本系遂於88學年度起調整並增開園藝相關生物技術課程，95學年度獲教育部核准調整系名為「園藝暨生物技術學系」。期使學生能由園藝之農學本質出發，增加在生物技術領域發展之學能。

本系隸屬農學院，設系迄今畢業生逾二千餘人，廣及於國內、外，園藝產、官、學、研各單位服務。縱或另有志趣專長發展，亦多能秉持校訓「質、樸、堅、毅」之精神，奮勉工作，貢獻社稷。

創系以來曾任本系系主任者有：詹純鑑、黃弼臣、程兆熊、鄭達文、吳恪元、李增生、李良，以及羅筱鳳等教師，現系主任由熊同銓老師兼任。