淡江大學前身為淡江文理學院，於民國47年成立商學系，民國52年設立夜間部會計統計學系，商學系復於民國54年成立商學部之時，分設工商管理、會計統計、銀行保險、國際貿易四學系，會計統計系創系主任為芮寶公教授。民國57年及59年商學部及夜間部會計統計學系各分設會計組，為本系歷史的肇始。商學部會計統計學系會計組，於民國62年改設為會計學系；夜間部會計統計學系會計組亦於民國63年獨自為會計學系，隸屬於夜間學院。民國69年淡江文理學院獲准升格為大學，成立管理學院，會計學系納入管理學院。在此時期，日夜系務行政分立，各有隸屬。日間部歷任系主任分別為沈樹雄(57年-66年)、 蔡信夫(66年-72年)、沈樹雄(72年-74年)擔任；而夜間部歷任系主任分別為尤士卿(59年-67年)、王美蘭(67年-73年)、黃振豊(73年-74年)擔任。74年8月，日夜系務行政合一，直接隸屬於管理學院。其後之系主任分別為黃振豊(74年-82年)、王美蘭(82年-88年)、黃振豊(88年-94年)、陳叡智(94年-100年)、張寶光(100年-104年)及顏信輝(104年-108年)等人，現任系主任為孔繁華(108年迄今)。