大學部大學部主要三大教育目標：
一、嫻熟英語文之溝通與應用；並能對第二外語有基本掌握。
二、透過文學、語言學及應用語言學之專業訓練，培養獨立思考與深度分析之能力。
三、培養國際視野。

為達成學士班教育目標，我們訂定五大核心能力：
一、溝通表達與語文能力。
二、經典作品分析能力。
三、問題發掘與研究能力（含用科學方法進行語言分析）。
四、創作與創新能力。
五、全球視野與多元文化認知能力。

碩士班碩士班「外國文學組」的教育目標：
一、培育英美及世界文學領域的學術研究人才。
二、強化文學作品解讀與文化現象解析所需的理論基礎，以拓展並深化思辨及研究能力。
三、訓練學生執行文學與文化研究及撰寫研究論文的能力。

其對應之核心能力如下：
一、對英美及世界文學作品各文類具備深度解析的能力。
二、對解析文學作品與社會、文化及歷史現象所需的理論基礎應有掌握，並了解理論及文本間密不可分之關係。
三、對文學作品及文化現象具備創造性解析的能力。
四、執行文學與文化研究及撰寫研究論文的能力。

碩士班「語言認知與教學組」的教育目標：
一、培育應用語言學領域（含外語教學）的學術研究人才。
二、培養學生對應用語言學之應用層面及實務上執行及解決問題力，並強化理論基礎，以拓展並深化思辨及研究能力。
三、訓練學生執行研究與撰寫研究論文的能力。
四、對英語教學活動之發展具有使命感並具有宏觀的國際視野。

其對應之核心能力如下：
一、知識與認知層面
（1）瞭解應用語言學之理論、實務與相關研究議題。
（2）瞭解教學趨勢，結合電腦科技之語言學習與教學研究。

二、職能導向層面
（1）具備發展教學教材、設計教學活動之能力。
（2）具備能夠蒐集和分析應用語言學相關領域的研究資料之能力。
三、個人特質層面
（1）具有專業反思及獨立研究的能力。
（2）具有因應社會、環境變革的能力。

四、價值與倫理層面
（1）對應用語言學學術及應用活動之發展具有使命感。
（2）具有宏觀的國際視野。

國立清華大學外國語文學系是一個文學與語言科學並重的學科，訓練學生融合人文思考並且培養科學實證的邏輯。系上符合文學與語言科學相關研究專長的師資各半，讓大學部的學生可以自由選擇專注文學、語言科學、或是平均發展的學習過程。研究生無論是文學組或是外語學習組都能在多元化的領域中吸收豐富的知識。本系最終教育目標是開拓學生的發展選擇，突破傳統對外語系的認知。