1.經濟學、統計學、會計學
2.農業金融
3.農產貿易
4.農產運銷
5.農企業管理
6.農業政策與發展
7.農業生產與管理
8.環境與資源管理

大學部與碩士班之教學方向以充實經濟、會計、統計、農業與環境資源、農產運銷及農業政策的基本知識，並增強其閱讀能力之素養，俾使學生畢業後到社會各部門，能快速吸收該部門的知識，並隨時吸收新的知識，以適應社會的需要。博士班的教學方向更以增強其閱讀世界第一等期刊之能力，使其能獨立自我發展，具有創新的能力，成為人文社會科學高級的研究人才為主要目標。此外，就研究方向而言，根據系上教授之研究領域及專長，大致可以區分為「政策、制度與法規」、「運銷、貿易與消費」、「生產與管理經濟」及「資源與環境經濟」 、「生技管理」、「國際經濟與投資」等六大領域，與我國當前的農業環境環環相扣，且各領域亦有相當突出的表現。

本系計畫在未來成立自然資源與環境經濟研究室、大陸農業經濟研究室、農業政策研究室等，以便配合時代需要，全面提升農業經濟之教學與研究水準。同時加強學術合作，與國外名校交換學生及教授，參與國際性研究計畫，支援開發中國家之農業援外計畫，以及舉辦國際農業經濟會議，以提升我國農業經濟學術在國際上的地位。