國立虎尾科技大學電子工程系成立於民國94年8月1日，目前每年招收四年制及二年制日間部學生各一班，99學年度奉教育部核准成立碩士班，招收15名碩士生。電子工程系的成立，主要在培育優秀電子工程專業人才，提昇我國電子產業的人力素質。本系強調理論與實務並重之教學，重視學生獨立思考與創造能力之培養。本校因地處中部科學園區虎尾基地旁，是中臺灣創新科技發展重心之一。

因此，電子工程系成立的宗旨，是希望整合本校電機資訊學院之資訊工程、電機工程、光電工程等系現有之研究及教學資源，結合新聘具產業實務經驗之優秀專業師資，發展電子技術之實務教學及產業應用性之研究，以培育我國e世代之電子工程師。

本系發展方向分為積體電路設計與製程、微電子與光電工程、通訊系統三個方向，希望培育出高科技相關產業具有實務能力之從業人員，包括半導體及積體電路、信號與系統工程、通訊工程等相關產業人才。除加強理論之傳授外，尤著重實務研修，透過專業理論之研究與實務技術之傳授，配合國家發展與因應電子、通訊等相關科技發展趨勢，在理論與實務並重的要求下，使學生成為具有設計、製造、運用與修護等實務能力之高級電子工程師，以符合社會需求為目標。電子工程系發展現況如下:

成立於民國94年8月1日，設置四年制及二年制大學部各1班
95學年度科技大學評鑑成績為一等
98學年度工程及科技教育認證通過
99學年度成立電子工程系碩士班
102年工程及科技教育通過認證3年
105學年度成立夜間部四年制大學部1班
108學年度成立日間部二年制專科1班