本系創立於民國80年，其系發展沿革如下:

80年 升格改制國立屏東技術學院機械工程技術系設立二年制日間部，每年招收一班

81年 二年制日間部每年招生兩班

82年 設立機械工程技術研究所，招收碩士班每年15名，分熱流、動力與控制及設計與製造三組

83年 開始招收二年制進修部每年1班，二年制日間部每年招收3班

86年 改名為國立屏東科技大學機械工程系(含碩士班)

89年 開始招收四年制日間部，每年招收1班，停招二年制日間部3班

89年 南訓二技在職專班1班，在職碩士專班1班

97年 停招二年制進修部，四年制日間部招收2班

105年 開始招收產學攜手專班1班

107年 停招碩士在職專班

110年 開始招收四年制進修部1班，技優領航專班1班，產學訓專班1班