本系核心能力為

1.食品專業基礎能力
2.食品化學檢驗分析能力
3.食品微生物檢驗技術能力
4.食品加工製程技術能力
5.食品專業統合能力
 

1.建立微生物發酵技術，開發具生物活性之保健產品。開發天然抗菌成份，研究提升食品安全及保存相關技術。協助產業界改善微生物發酵製程、提供微生物檢驗及鑑定等服務。
2.建立保健食品相關加工與包裝技術、引進微波加工、氣調包裝貯存等技術，應用於國產原物料生產，新產品開發，提昇食品產業的研發水準並協助其轉型。
3.建立層析分離、質譜分析和DNA檢測技術，配合細胞培養及抗氧化特性的研究，提供生技和保健食品生理活性物質的鑑定並闡明其作用機制，促進生技和保健食品的發展。