民國 8年 4月 創校，原名「臺灣公立嘉義農林學校」。

民國37年 8月 增設「農產製造科」。

民國54年 3月 改制為專科學校，名為「臺灣省立嘉義農業專科學校」，設立「農產加工科」。

民國60年 7月 夜間部增設農產加工科。

民國64年 8月 增設二年制日間部，設食品加工科。

民國65年 4月 夜間部農產加工科易名為食品加工科。

民國70年 7月 改制為「國立嘉義農業專科學校」。

民國78年 8月 食品加工科易名為「食品工業科」。

民國86年 7月 改制為「國立嘉義技術學院」，設一「食品科學系」 。

民國89年 2月 升格為「國立嘉義大學」，增設「食品科學研究所」碩士班。

民國89年 9月起 進修推廣部改為二年制技術系。

民國92年 8月起 進修推廣部增設四年制學士班。

民國95年 8月起 「食品科學研究所」碩士班分組為「食品科技組」及「保健食品組」。

民國95年 8月起 進修推廣部二年制技術系停招，增設「二年制在職專班」。

民國95年 8月起 日間部二年制技術系停招，大學部增額為兩班。

民國96年 8月起 日間部「食品科學博士班」、「食品科學暨生物藥學研究所碩士在職專班」正式開始招生。

民國100年 8月起 「食品科學暨生物藥學研究所碩士在職專班」正式更名為「食品科學研究所碩士在職專班」。