民國八年，創立本校「臺灣公立嘉義農林學校」，本校即源自林科。
民國五十四年改制為專科「臺灣省立嘉義農業專科學校」，設置有森林科，修業五年。
民國五十八年森林科奉准分設森林經營組和森林利用組。
民國六十六年增設森林利用科夜間部，修業三年。
民國七十年改制為「國立嘉義農業專科學校」，增設二年制森林利用科。
民國七十八年奉准五專部分別更名為資源管理組及林產利用組，二專部改為森林科林產利 用組，二專夜間部改設森林科。
民國八十二年五專及二專部林產利用組均改為林產工業科，二專夜間部森林科亦改為林產工業科。
民國八十六年學校改制為「國立嘉義技術學院」， 系名為木材科學系 。
民國八十八年停二專而增設四年制木材科學系。
民國八十九年與「嘉義師範學院」整併改制為「國立嘉義大學」，停五專及四技，設立林產科學系大學部，並與森林學系共同成立林業研究所碩士班， 分成林學組與林產組招生， 於進修推廣部設立二年制木材科學系，修業三年。
民國九十年於進修部設立林業研究所碩士在職專班。
民國九十一年林業研究所名稱調整為林業暨自然資源研究所，分設經營組、自然資源組及林產組。
民國九十二年度於林業暨自然資源研究所組別，分別調整為自然資源組、林產工業組
民國九十二年停招進修推廣部二年制木材科學系，改招四年制木材科學暨工藝學系學士學位班。
民國九十三年農學院為發展及提升學術水準，奉教育部核定設立農學所博士班分農藝、園藝、林業三組，第一年招收三位博士生，第二年招收六位。
民國九十五年起， 配合學校 系所合一， 將自然資源組調整為森林暨自然資源學系碩士班及林產科學系碩士班 ，並得五年修得學、碩士學位。 而原碩士在職專班則歸屬農學院農學所林業組，繼續辦理招生業務。
民國九十五年度起農學所博士班整併成動物組及植物組，每年招收六名博士生。
民國九十五年度起 年因為農學院組織調整，在本所開辦在職碩士專班林學組一班，招收森林及林產科學領域在職學生進修碩士學位。
民國九十五年度起農學所博士班分為 農藝、園藝、森林、林產科學、動物科學、獸醫學、農業生物技術等領域，每年招收七名博士生。
民國九十八學年度起業經教育部 97 年 10 月 21 日 臺高 ( 一 ) 字第 0970209421 號函同意名案『林產科學暨家具工程學系』。
民國101年8月1日起業經教育部100年9月30日 臺高(一)字第1000177626 號函同意更名『木質材料與設計學系』。