真理大學承襲馬偕博士的教育理念，非常重視通識教育，其前身淡水工商管理專科學校是以管理及財經為主的學校，但也聘請許多人文專長的師資，以作育具全人素養之學子。臺灣高等教育向來重理工、輕人文，社會發展有相當程度的扭曲，確實衍生若干問題。幸好近年來，重視人文教育與跨領域知識之整合呼聲漸漸得到認同，這與真理大學的教育理念不謀而合，2008年「人文與資訊學系」的設立可謂延續馬偕精神。

在追尋整合跨領域知識的趨勢下，本校積極匯整現有許多優秀的人文與社會科學師資，再搭配部分資訊科學的師資，設置了「人文與資訊學系」。97學年度首度招生，名額為50名，歸屬第一類組。以學校優雅的人文環境及充實的師資，積極推動以現代資訊科學的新技術，來協助人文事業有效發展之教育理想，學生未來的發展將可樂觀預期。

2008年8月1日由吳銘達校長遴聘陳俐甫教授為本系首任系主任(其後連任，前後任職2008年8月1日~2011年7月31日)。

2011年8月1日由吳銘達校長遴聘劉鴻暉教授接任本系第二任主任(任職時間為2011年8月1日~2013年7月31日)。

2013年8月1日由林文昌校長遴聘殷寶寧教授接任本系第三任主任(任職時間為2013年8月1日~2015年1月31日)。

2016年2月25日由林文昌校長遴聘劉亞蘭教授接任本系第四任主任(任職時間為2016年2月25日~2018年7月31日)。

2018年8月1日由陳奇銘校長遴聘金凱儀教授接任本系第五任主任(任職時間為2018年8月1日~2020年7月31日)。

2020年8月1日由陳奇銘校長遴聘吳明憲教授接任本系第六任主任(任職時間為2020年8月1日~迄今)。