資訊管理學系設立之目的，在於因應國家經濟建設所需，並配合資訊產業政策及發展計劃，積極培育及儲備資訊管理人才。有鑑於此，民國八十一年八月一日，本校前身(國立屏東商業專科學校)成立之次年即奉准成立資訊管理科，當時招收日間部專科二年制一班。復於民國八十三年八月一日成立二年制在職班一班。本系之沿革如下：

1.民國八十七年七月一日本校正式改制為國立屏東商業技術學院，本科亦於八十八年八月一日設立資訊管理系，並招收二技日夜間部各一班。二專日間部停止招生。
2.民國八十九年八月一日，本系增設進修推廣部四年制一班，進修推廣部二年制在職班停止招生。
3.民國九十一年八月一日，新增資訊管理研究所一班，每年招收20名碩士班研究生。
4.民國九十二年八月 一日，新增四技日間部一班，二技日間部停止招生。
5.民國一○三年八月一日，國立屏東商業技術學院與國立屏東教育大學合併為國立屏東大學，本系亦同時改稱資訊管理學系。

資訊管理學系發展至今計有研究所碩士班每年級一班，日間部四技每年級一班，進修推廣部四技每年級一班，總計10個班級。本系目前有專任教師10位，其中教授3位，副教授4位，助理教授2位，講師1位，專長領域橫跨網路管理、資料探勘與深度學習、資料庫管理、大數據分析、資訊管理、組織行為、資訊倫理、供應鏈管理、人工智慧應用、金融資訊、決策支援系統及資訊安全等領域，教師專長已能滿足資訊管理各領域的專業技能。