1.呼吸治療專業能力
2.臨床醫學相關能力
3.團隊合作及溝通協調能力
4.主動求知與尋找資源的能力
5.獨立思考能力與解決問題能力

1.教學部分：
（1）具備完善之教學軟硬體設備及教學環境：本系設有完善的軟硬體教學設備如儀器設備、實驗教室、示範病房、電腦輔助教學設備等，以提供學生實際操作及臨床狀況模擬之練習，並與長庚醫院建教合作，該院擁有全國最大之呼吸治療科，具完善的設備及優良的照護品質和工作人員，提供學生良好的實習環境。
（2）聘任學識背景及臨床經驗豐富之教師：本系專任師資主要具備呼吸照護專業背景為主，並積極邀聘長庚醫院、臺大醫學院（臺大醫院)、國防醫學院（三軍總醫院)、陽明醫學院（榮民總醫院)等現任呼吸治療專業相關之臨床醫師及呼吸治療師等教師參予呼吸照護專業之課程指導，使教學能將理論與臨床結合。
（3）課程規劃符合國內呼吸治療發展之趨勢：結合國內外呼吸治療專業發展，本系每學年透過雙迴圈制度進行課程規劃的評估與調整，使課程安排更加完整並與臨床實務結合，以符合臨床人才能力需求。
（4）培養學生獨立思考與解決問題能力：本系學生於畢業前需完成專題論文，本系教師專業背景呈現多樣化，學生可依個人興趣選擇研究主題，再由相關專長之教師擔任指導教授。
（5）師生關係互動密切：本校導師輔導制度完善，加上本系設有多種師生溝通管道，如師生座談會、師生晤談、各項會議及系學會活動，適時關懷學生學習與生活輔導問題，故本系師生互動關係融洽。

2.研究部分：
（1）鼓勵學生參與研究及培養學生研究能力：為落實本系教育目標與核心能力養成，提升學生未來職場競爭力，本系大四學生必須分組完成呼吸照護專題實作，並舉辦成果發表會，以公開口頭報告方式呈現專題研究成果，以評估學生之學習成效。同時亦鼓勵學生參與校外研究計畫申請或發表學術會議論文。
（2）設立呼吸照護研究所：本系自97學年度起於臨研所下籌設呼吸暨重症照護組碩士班，是國內首開培育呼吸照護研究人才之班制，該組研究生的畢業門檻為研究成果必須發表在國內外學術期刊或學術研討會。
（3）教師研究成果豐碩：本系專任教師研究方向以呼吸照護臨床應用研究與心肺基礎醫學研究為主，許多論文刊登於國內外學術期刊，每年皆有教師承接國科會、長庚醫學研究計畫，充分發揮學術卓越與臨床結合之精要。
（4）跨校研究合作：透過跨校團隊合作研究，可結合各校教學研究資源，提昇教師學術實力，本系專任教師近年積極與國內大學如臺灣大學、師範大學、成功大學、輔仁大學、弘光科技大學等校進行研究合作。
（5）學校與醫院臨床研究合作：結合本系師資研究專長與長庚醫院區研究資源，本系教師與醫院臨床密切進行研究合作，促進研究能量。

3.國際化部分：
（1）積極邀請國外學者訪視與學術交流：本系自97學年度起每年邀請2-3位國外學者來臺進行專家演講與訪視，至101學年度已辦理近12人次國外學者蒞校專題演講與訪視，給予本系教學研究建議與增加學術交流機會，並與長庚醫院呼吸治療科、呼吸治療學會、臺灣胸腔暨重症加護醫學會舉辦國際性學術研討會，使本系師生有學習交流的機會。
（2）締結姊妹學系：為能進一步促進呼吸治療國際學術交流，本系與美國呼吸治療教育與研究領域排名前二名之喬治亞州立大學呼吸治療學系、德州大學聖安東尼奧分校呼吸照護學系簽訂學術合作，共同進行教學與研究合作。
（3）跨國研究合作：為擴展本系研究深度與廣度，本系教師與國外知名大學實驗室共同進行研究合作及論文發表，如在吸入性藥物輸送研究方面，本系與美國喬治亞州立大學呼吸治療學系簽訂學術合作合約共同進行實驗室建立合作，並已發表相關論文於學術期刊上。在肺動脈高壓研究方面，本系教師與德國GiessenUniversity、美國StanfordUniversity及日本MieUniversity進行肺動脈高壓致病機轉實驗合作。
（4）辦理交換學生：本系徵選大三以上學生前往美國合作學校進行交換學生，讓學生可以實際體驗異國生活及學習，除了對自我成長有很大的幫助外，更能擁有國際學習經驗。
（5）招收外國學生與僑生入學：本系每年提供2名外國學生與3名僑生入學，除提供學生外語學習機會，也讓學生能有不同之互動學習機會與文化體驗。
(6）每年辦理海外臨床實習：本系每年辦理教育部新南向學海築夢計畫申請選送學生至新加坡醫院臨床實習與廈門長庚醫院暑期海外實習。

本校的辦學理念是培育知識與德性兼備、理論與實務結合，能身體力行、終身學習、貢獻社會的人才。校務發展目標是朝向具有重點特色的研究型大學之目標邁進，並結合企業資源，推動產學合作，積極使校務國際化，以培養醫療服務業、生技以及高科技產業需要之高級人才。秉持本校辦學理念與發展目標，以及醫學院「培育兼具現代基礎醫學知識與臨床醫學技能之優秀生物醫學人才」之教育目標，本系之設立宗旨在於：培育呼吸照護相關人才，以及發展呼吸照護相關產學合作研究。循此宗旨，本系的教育目標設立為：

（一）培養全面性呼吸照護專業能力與多元發展
（二）終身學習與解決問題能力