醫療系統攸關整體國民的健康品質，更進一步影響國家整體經濟的發展，因此如何善用醫療資源遂成國家整體發展的重要一環。由於醫療資源與醫病相關資訊量大且複雜，因此如何利用資訊及網路科技協助醫療機構提昇醫療品質也成為一重要的學術發展發方向。

本校及附屬醫院在醫學相關領域已有相當傑出的表現，為更進一步提昇學校整體發展潛力，於92學年度成立資訊管理學系，招收第二類組學生，配合本校教學醫院之資源與發展，期能培養兼具資訊、網路、管理及應用（特別是醫學相關領域）的全方位知識經濟時代人才。97學年度更名「應用資訊科學學系」，同年成立碩士班。

因應少子化及老人化問題，醫學資訊跨領域相關應用乃未來趨勢，101學年度起更名為醫學資訊學系，結合學校教學醫院資源與發展，期能培養兼具資通訊等相關技術應用於醫學(醫療)、健康照護之專業人才。