昆蟲生理與生化利用最新科技探討昆蟲生理生化機制，例如：生長、發育、內分泌、神經生理、農藥毒理及昆蟲抗藥性等。

昆蟲與植物交互作用從事昆蟲與植物交互作用之化學生態學研究，例如：植物化學物質對昆蟲生長發育之影響及昆蟲媒介病毒之機制等。

害蟲防治開發與應用各種害蟲防治技術，例如：生物防治、微生物防治及化學防治等，以防治農作物害蟲與環境衛生害蟲。

昆蟲分類與演化利用傳統與分子生物學知識研究昆蟲分類、生物系統及演化等，並將成果應用於防檢疫害蟲鑑定、昆蟲多樣性調查等實務。

生態學與保育研究生態學之理論與應用，探討環境中之生物與非生物因子對昆蟲族群動態之影響與其理論，發展電腦模擬技術，並實際應用於生態保育與永續農業。

大學部教育目標培育具生命科學、昆蟲學、植物保護與檢疫、生態保育等學識之基礎科學研究與實務能力之人才。

碩博士班之教育目標培養具獨立研究、創新與明辨是非思考能力之高級科學研究與應用人才。