（一）本系教學與研究發展目標強調三個特色：（1）跨文化視野；（2）縱時間深度；（3）究社會實踐。為達成上述目標，訂定系教育標地、課程規劃與研究、學生輔導之發展方向：（1）學士班，一方面透過基礎理論課程、區域民族誌與專題等課程，期許學生具備理解人類社會文化發展歷程的能力，以及理解文化多元性、包容差異並能關懷、反省當代社會問題的素養。另一方面，鼓勵學生運用選修、雙修或輔系等方式廣泛地接觸跨本系的相關課程以開拓視野，落實通才培育的目標，在現實生活中具備適當的視野與落實的能力，以思考個人生涯發展、關懷與反省當代社會問題。（2）碩士班，加強邏輯思考和表達溝通能力的訓練，期冀培訓具探究進階學問的能力或具實務工作的能力，做為進一步從事學術研究或參與推廣各層級文化發展政策的基礎。（3）博士班，加強問題分析批判與獨立研究能力的訓練，以培育具前瞻性及國際視野的專業考古學與社會文化人類學學者。

（二）、研究與發展目標根據國科會民國95年的調查，「文化與族群的形成與再創造」、「地方社會與區域發展」等議題，因具歷史過程與社會文化的動態性研究分析，被視為是前瞻性的議題。因此，本系在規劃發展方向時，也將此學科之專業發展、臺灣社會原住民文化權與社會運動、全球化與人類學之應用等具當代社會性與需求的議題，納入發展的規劃之中，期望進一步強化本系在當代社會文化議題上的研究發展與社會參與的基礎。在考古學方面，無論是國科會視為前瞻議題的「古代聚落型態分析」，或推動的「南島族群與文化之起源與分布」等，本系教師皆有所從事者；另，近年來積極與國際及校內相關單位合作，試圖發展跨領域議題的研究基礎，以呼應考古學在國際上的發展趨勢。

此外，人類學系附屬標本陳列室也是本系的發展重點之一，此標本陳列室，藏有豐富珍貴的日治時期至今臺灣各族群的歷史影像與物質文化標本，成為珍貴的教學與展示資源。近年來配合典藏數位化與應用等議題的發展，如何賦予人類學藏品新的社會意義也成為本系主要的發展重點之一。