系所特色學程規劃課程方面，主要目的是希望藉由規劃之課程幫助學生了解晶片設計軟硬體架構之應用，以建立其具備開發客製化晶片產品的能力，並透過配合學生專題製作的進行，增加系所對產業界爭取產學合作或建教合作的機會，提升使用效益。其跨領域特色學程部分，由於半導體暨光電元件之應用未來發展無可限量，為加強學生對半導體與光電元件之觀念及製程能力，並可藉由實務量測的課程，使學生掌握綠色能源元件之特性與分析，和相關製作技術；並以此基礎，透過專題製作與跨領域特色學程的實施，讓學生得以整合半導體與光電元件積體電路，光電感測元件，生物晶片或嵌入式射頻系統之知相關特性與技能。