國立臺北大學金融與合作經營學系之前身為臺灣省地方行政專科學校「行政科」，成立於民國 38 年。於民國 44 年升格為臺灣省立法商學院合作學系，民國 53 年成立進修學士班，並於民國 64 年 3 月更名為「合作經濟學系」。歷年來經歷臺灣省立法商學院、臺灣省立中興大學，國立中興大學，國立臺北大學等數次之改制，本系不斷的成長與茁壯，於 89 學年度年成立碩士班，並於 98 學年度正式改名轉型為「金融與合作經營學系」。本系設有三種學制，包括碩士班一班 (每屆11名)、大學日間部一班 (每屆54名) 與進修學士班一班 (每屆54名)。101 學年度奉教育部核准新增"財務金融後學士學位學程"一班(每屆60名)。

民國 42 年臺灣省立行政專科學校合作行政科
民國 44 年升格為臺灣省立法商學院合作學系
民國 50 年法商學院與臺灣省立農學院合併， 改制為臺灣省立中興大學
民國 53 年增設臺北夜間部合作學系
民國 61 年改制為國立中興大學法商學院合作學系
民國 64 年本系改名為合作經濟學系
民國 89 年2月1日 國立中興大學法商學院改制為國立臺北大學，本系同時成立碩士班，並招收春季班學生
民國 90 年碩士班招生改為秋季班學生，並停招春季班。
民國 97 年改制為金融與合作經營學系
民國 101 年新增"財務金融後學士學位學程