醫務管理學系目前橫跨日夜學制計有學士班、碩士班及碩士在職專班三個學制。

(一)學士班之成立與發展

學士班於民國 87 年成立，招收 1 班，民國 91 年增加招生名額為每屆2班。義聯集團於本系設立兩年後，開始籌設義大醫院，本系鼓勵學生利用實習機會參與義大醫院創立期的實務工作，義大醫院正式營運後，多項課程更進一步結合醫院的師資與教學資源，提供學生實務學習經驗。

(二)碩士班之成立與發展

為進一步培養醫療機構中高階醫務管理人才，與增進醫務管理學術研究，民國 95 年設立碩士班，平均每年招收研究生 10 名，以提供學生精進醫務管理專業知識、學術研討及實務研習等能力。

(三)碩士在職專班之成立與發展

為提供已任職於醫療照護體系工作者或是有興趣投入醫療與高齡照護產業者自我職場增能的機會，民國101年成立碩士在職專班，平均每年招收在職碩士生 20 名，以提供在職人員終身學習與繼續教育之機會，期能將學習成果帶入服務職場，活化職場專業知能。