本系教學兼重理論與實驗，課程內容涵蓋微生物學領域各項重要及相關的主題，展現微生物學多元特色。由課程、實驗、實習及演講中，培育學生具有廣博的微生物學及相關專業知識與技術，培養探究生命科學的基本能力，尤其重視書報討論課程，對學生施以專業知識的理解、統整及表達能力的系列訓練；為結合理論與實務，鼓勵學生修習學士論文，增強專業探究能力；推動產學實習，協助學生參與系友任職為主單位的暑期實習，強化學生的就業力。對於學生未來在研發、生技產業等職涯之養成和發展極具助益。

研究計畫： 
本系自組研究團隊，多次獲得科技部私校發展特色專案計畫及跨領域計畫補助，包括「微生物技術應用於文蛤養殖環境知監測與優化」、「綠色海水養殖環境微生物製劑之開發與應用」、「醫療用藥物污染環境之復育研究」，「溴化阻燃劑污染之河川底泥與陸棲環境之復育研究」。